16 Kirchengemeinden -verstreut in den Landkreisen Passau, Freyung-Grafenau und Rottal-Inn sowie in der Stadt Passau- bilden zusammen den Dekanatsbezirk Passau, an dessen Spitze Dekan Jochen Wilde steht.
Die Leitung des Dekanatsbezirks liegt bei der Dekanatssynode, deren Mitglieder von den jeweiligen Kirchengemeinden und ihren Kirchenvorständen entsandt wurden, und dem Dekanatsausschuss. Der Dekanatsausschuss wird wiederum aus der Mitte der Dekanatssynode gewählt.
In diesen Gremien wird über die Finanzen des Dekanats, über Stellen und inhaltliche Fragen beraten und entschieden.